MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-64 chromosome

Total Repeats: 138000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016948	GCC	2	6	87	92	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759438
2	NC_016948	CAC	2	6	98	103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379759438
3	NC_016948	GCA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759438
4	NC_016948	TCG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759438
5	NC_016948	CTG	2	6	183	188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759438
6	NC_016948	AGC	2	6	198	203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759438
7	NC_016948	GCC	2	6	259	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759438
8	NC_016948	ACA	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379759438
9	NC_016948	CGA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759438
10	NC_016948	CGG	2	6	340	345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759438
11	NC_016948	CGA	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759438
12	NC_016948	CGC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759438
13	NC_016948	CGA	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759438
14	NC_016948	CGC	2	6	497	502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759438
15	NC_016948	CCG	2	6	518	523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759438
16	NC_016948	CG	3	6	606	611	0 %	0 %	50 %	50 %	379759438
17	NC_016948	TGC	2	6	661	666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759438
18	NC_016948	CGC	2	6	668	673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759438
19	NC_016948	TCA	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379759438
20	NC_016948	CGA	2	6	764	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759438
21	NC_016948	TGC	2	6	811	816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759438
22	NC_016948	TCG	2	6	817	822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759438
23	NC_016948	AAGG	2	8	846	853	50 %	0 %	50 %	0 %	379759438
24	NC_016948	TTC	2	6	867	872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379759438
25	NC_016948	CAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379759438
26	NC_016948	GCC	2	6	929	934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759438
27	NC_016948	AGC	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759438
28	NC_016948	CGA	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759438
29	NC_016948	CAG	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759438
30	NC_016948	CCA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379759438
31	NC_016948	GCC	2	6	1263	1268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759438
32	NC_016948	CCG	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759438
33	NC_016948	ACC	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379759438
34	NC_016948	GAA	2	6	1296	1301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379759438
35	NC_016948	ACCAC	2	10	1417	1426	40 %	0 %	0 %	60 %	379759438
36	NC_016948	CGCAA	2	10	1438	1447	40 %	0 %	20 %	40 %	379759438
37	NC_016948	GCG	2	6	1469	1474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759438
38	NC_016948	CAC	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379759438
39	NC_016948	CGA	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759439
40	NC_016948	GTGG	2	8	2151	2158	0 %	25 %	75 %	0 %	379759439
41	NC_016948	GAA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379759439
42	NC_016948	CGGTGC	2	12	2183	2194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379759439
43	NC_016948	TGC	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759439
44	NC_016948	CGA	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759439
45	NC_016948	CCG	2	6	2489	2494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759439
46	NC_016948	CGGG	2	8	2535	2542	0 %	0 %	75 %	25 %	379759439
47	NC_016948	GGT	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379759439
48	NC_016948	GCC	2	6	2605	2610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759439
49	NC_016948	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759439
50	NC_016948	GCC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759439
51	NC_016948	GCA	2	6	2813	2818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759439
52	NC_016948	GCT	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759439
53	NC_016948	GCCG	2	8	2865	2872	0 %	0 %	50 %	50 %	379759439
54	NC_016948	CGA	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759439
55	NC_016948	GGCCG	2	10	3016	3025	0 %	0 %	60 %	40 %	379759439
56	NC_016948	AAG	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379759439
57	NC_016948	CGAT	2	8	3038	3045	25 %	25 %	25 %	25 %	379759439
58	NC_016948	TGC	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759439
59	NC_016948	GAC	3	9	3178	3186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759439
60	NC_016948	CCGGG	2	10	3197	3206	0 %	0 %	60 %	40 %	379759439
61	NC_016948	CCGA	2	8	3223	3230	25 %	0 %	25 %	50 %	379759439
62	NC_016948	GCC	2	6	3463	3468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759440
63	NC_016948	ACG	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759440
64	NC_016948	CGC	2	6	3531	3536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759440
65	NC_016948	GGGC	2	8	3538	3545	0 %	0 %	75 %	25 %	379759440
66	NC_016948	GCA	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759440
67	NC_016948	GC	3	6	3606	3611	0 %	0 %	50 %	50 %	379759440
68	NC_016948	GTT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379759440
69	NC_016948	GCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759440
70	NC_016948	CGC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759440
71	NC_016948	CGA	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759440
72	NC_016948	CGGC	2	8	3700	3707	0 %	0 %	50 %	50 %	379759440
73	NC_016948	GGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759440
74	NC_016948	GTGC	2	8	3718	3725	0 %	25 %	50 %	25 %	379759440
75	NC_016948	TGC	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759440
76	NC_016948	GC	3	6	3779	3784	0 %	0 %	50 %	50 %	379759440
77	NC_016948	GCC	2	6	3833	3838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759440
78	NC_016948	CTG	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759440
79	NC_016948	CGC	2	6	3981	3986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759440
80	NC_016948	CGG	2	6	3999	4004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759440
81	NC_016948	GGTC	2	8	4086	4093	0 %	25 %	50 %	25 %	379759440
82	NC_016948	GAC	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759440
83	NC_016948	GCCA	2	8	4147	4154	25 %	0 %	25 %	50 %	379759440
84	NC_016948	CGC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759440
85	NC_016948	GC	3	6	4209	4214	0 %	0 %	50 %	50 %	379759440
86	NC_016948	CGA	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759440
87	NC_016948	GTT	2	6	4233	4238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379759440
88	NC_016948	CGA	2	6	4242	4247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759440
89	NC_016948	CTCGA	2	10	4261	4270	20 %	20 %	20 %	40 %	379759440
90	NC_016948	GCGCC	2	10	4275	4284	0 %	0 %	40 %	60 %	379759440
91	NC_016948	CCG	2	6	4325	4330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759440
92	NC_016948	GTC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759440
93	NC_016948	CGG	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759440
94	NC_016948	GC	3	6	4419	4424	0 %	0 %	50 %	50 %	379759440
95	NC_016948	GCG	2	6	4603	4608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759441
96	NC_016948	GC	3	6	4664	4669	0 %	0 %	50 %	50 %	379759441
97	NC_016948	GGT	2	6	4738	4743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379759441
98	NC_016948	CCA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379759441
99	NC_016948	GAT	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379759441
100	NC_016948	GTT	2	6	4855	4860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379759441
101	NC_016948	CGC	3	9	4870	4878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759441
102	NC_016948	GTG	2	6	4892	4897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379759441
103	NC_016948	GCCG	2	8	4918	4925	0 %	0 %	50 %	50 %	379759441
104	NC_016948	CG	3	6	4971	4976	0 %	0 %	50 %	50 %	379759441
105	NC_016948	AGA	3	9	5258	5266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379759442
106	NC_016948	CAC	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379759442
107	NC_016948	GGT	2	6	5391	5396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379759442
108	NC_016948	CGA	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759442
109	NC_016948	CAA	2	6	5433	5438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379759442
110	NC_016948	CGA	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759442
111	NC_016948	CGT	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759442
112	NC_016948	CGG	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759442
113	NC_016948	CGG	2	6	5574	5579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759442
114	NC_016948	GGT	2	6	5631	5636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379759442
115	NC_016948	CAC	2	6	5757	5762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379759442
116	NC_016948	ACC	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379759442
117	NC_016948	GC	3	6	5824	5829	0 %	0 %	50 %	50 %	379759442
118	NC_016948	CAA	2	6	5853	5858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379759442
119	NC_016948	CGA	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759442
120	NC_016948	GAG	2	6	5899	5904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379759442
121	NC_016948	GTC	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759442
122	NC_016948	GTC	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759442
123	NC_016948	CCG	2	6	5930	5935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379759442
124	NC_016948	GGC	2	6	5961	5966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759442
125	NC_016948	GCACC	2	10	5994	6003	20 %	0 %	20 %	60 %	379759442
126	NC_016948	CGG	2	6	6015	6020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759442
127	NC_016948	CAG	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759442
128	NC_016948	CAT	2	6	6075	6080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379759442
129	NC_016948	CGG	2	6	6135	6140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759442
130	NC_016948	GGC	2	6	6190	6195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759442
131	NC_016948	GC	3	6	6218	6223	0 %	0 %	50 %	50 %	379759442
132	NC_016948	GGT	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379759442
133	NC_016948	AAG	2	6	6256	6261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379759442
134	NC_016948	CTG	2	6	6262	6267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379759442
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257	NC_016948	CGA	2	6	10716	10721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759443
258	NC_016948	TGT	2	6	10727	10732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379759443
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260	NC_016948	ACCT	2	8	10756	10763	25 %	25 %	0 %	50 %	379759443
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262	NC_016948	CGG	2	6	10779	10784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379759443
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384	NC_016948	TGG	2	6	17000	17005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379759451
385	NC_016948	CG	3	6	17048	17053	0 %	0 %	50 %	50 %	379759451
386	NC_016948	CGA	2	6	17064	17069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379759451
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